آیت الله خاتمی در گفتگو با خبرنگار مهر در زنجان گفت: یکی از نقاط ضعف این دولت، دلبستگی به یک فرد خاص بود و همه خوبی‌ها را فدای یک نفر کرد و نقطه ضعف بعدی، عملکرد مشکل‌آفرین دولت دهم در مجلس شورای اسلامی بود که مقام معظم رهبری آن را خلاف شرع خواندند و همچنین همراهی دکتر احمدی نژاد با مشایی در ثبت نام برای انتخابات ریاست جمهوری توجیه نادرستی بود.
وی در عین حال با بیان اینکه دولت نهم و دهم فعالیت های قابل ستودنی طی دوران ریاست جمهوری خود داشت، ادامه داد: اگرچه دولت بعضا نقاط ضعفی از خود نشان داد، اما کابینه، وزرا، استانداران و فرمانداران، کارنامه شایسته‌ای به جا گذاشتند که از نقاط مثبت آن بود.
آیت الله خاتمی در مورد عملکرد دولت نهم و دهم افزود: انصاف در همه عرصهها شرط اخلاق است و نباید فراموش کنیم که دولت نهم و دهم خدمات ارزندهای داشتند. به عنوان مثال هدفمندسازی یارانهها، سامان دادن قیمت‌ها، سختکوشی و خستگی‌ناپذیری و شجاعت در عرصه‌های بینالمللی، نقاط قوت این دولت بود و بنا به فرموده مقام معظم رهبری دولتهای بعدی نیز باید این نقاط قوت را داشته باشند.
عضو مجلس خبرگان رهبری با بیان اینکه نقاط ضعف دولت دکتر احمدی نژاد نقاط قوت دولت وی را تحت الشعاع قرار داده است افزود: باید در پایان کار این دولت در رابطه با عملکرد آن منصفانه عمل کرده و فراموش نکنیم فضای نقد منصفانه زیرساخت رشد کشور است و جایی که فقط یک صدا شنیده شود، پیشرفتی صورت نمی‌گیرد بلکه باید همه صداها شنیده شوند و منطقیترین و شایستهترین آن‌ها گزارش شود.
آیت الله خاتمی با بیان اینکه خداباوری پایبندی به دین و ارزشها و نفرت از استکبار، سه مبنای اصولی انقلاب اسلامی هستند، افزود: اگرچه ما باور نداریم این مبانی آسیب دیده باشند ولی چون تلاش دشمنان گسترده است، مسئولان باید با جدی گرفتن این عرصهها، جلوی تبعات و آسیبهای احتمالی را بگیرند.
وی ادامه داد: بزرگترین خطر فرهنگی که ما را تهدید می‌کند تزلزل در مبانی اصولی انقلاب اسلامی است و باید همه آحاد جامعه در زمینه مقابله با این تهدید آماده باشند.
امام جمعه موقت تهران در خصوص مذاکرات با آمریکا افزود: در این رابطه نظر صائب، نظر مقام معظم رهبری است و تصمیم‌گیرنده نهایی شخص ایشان هستند ولی بهتر است دولت در حدود حرکت کند و مرزهای ترسیم شده را رعایت کنند.
